Согласно Уставу единоличным исполнительным органом образовательной организации является директор. В лицее сформированы коллегиальные органы управления, к которым относятся:
- Общее собрание работников Учреждения
- Педагогический совет Учреждения;
Центр технической поддержки
Руководитель - Пятаева Ирина Николаевна
Системный администратор Муль Павел Фридрихович
Системный администратор Зырянов Алексей Юрьевич
Столовая
Заведующая столовой основного корпуса – Лысцова Надежда Михайловна
Лаборатория робототехники
Руководитель - Яковина Ирина Николаевна
Педагог-организатор Яковина Павел Юрьевич
Полигон Турнира юных физиков
Руководитель - Пятаева Ирина Николаевна
Центр дополнительных платных услуг
Педагог дополнительного образования - Науменко-Тарасова Алена Леонидовна
ЛИГА (Лицейская инициативная группа) - Ученический орган соуправления
Некоммерческое партнерство развития и поддержки "Инженерного лицея НГТУ"
Председатель Партнерства – Васильева Тамара Ивановна
Это государство в государстве.